——恭賀生科院馮雁團隊開發 “A-Star" 低豐度SNV核酸富集和檢測新技術,實現萬分之一基因突變體的檢出。
2021年4月27日，上海交通大學生命科學技術學院、微生物代謝國家重點實驗室馮雁團隊在Nucleic Acids Research（當前影響因子：11.501）在線發表學術論文“Argonaute integrated single-tube PCR system enables supersensitive detection of rare mutations"。
上海交通大學副研究員劉倩和博士生郭翔為該論文共同第一作者，馮雁教授為通訊作者。研究工作由上海交通大學、上海交通大學附屬第一醫院、仁濟醫院、人和未來生物科技公司等合作完成。上海交通大學轉化醫學中心提供研究平臺支持。
文章簡介
針對血液或體液中腫瘤細胞釋放DNA片段的液體活檢技術，憑借其無創性、敏感性、動態性等特質，可實現腫瘤早期篩查及伴隨診斷。然而，由于游離核酸含量低和易降解，因此在復雜背景基因中來特異性富集和檢測腫瘤基因得到廣泛關注。常用的PCR等方法具有簡單、省時等優點，但其檢測靈敏度有限；近年來，基因編輯工具酶CRISPR/Cas在核酸檢測中的應用，提升了檢測靈敏度和便捷性，但Cas酶對靶標序列PAM選擇性、長鏈guide RNA合成昂貴且不穩定等問題，導致檢測成本、靈敏度、多重性等方面仍存在局限性。因此，研發能特異性富集靶標序列的新型核酸酶是解決上述難題的有效途徑，建立高靈敏度、多重和簡便的新型核酸檢測技術對于基礎研究和臨床應用都具有重要意義。
該工作揭示了不同高溫微生物 Argonaute蛋白的核酸酶特性，發現其對單堿基突變（SNV）靶標序列精準識別的規律，發展了“一管式"PCR多重核酸富集和檢測的A-Star（Ago-Directed Specific Target Enrichment and Detection）新策略，實現血液等樣本中低豐度突變基因的高效、多重富集和檢測。
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更新時間：2021-08-18
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